Élu le 4 décembre 2024 par la Conférence des évêques suisses comme son président, Mgr Morerod entamera cette mission le 1er janvier 2025.

Il s’agit de son 2e mandat à la tête de la CES (il en a été le vice-président de 2013-2015 puis le président entre 2016-2018). Il travaillera aux côtés de Mgr Joseph Maria Bonnemain, évêque de Coire, vice-président, et de Mgr Josef Stübi, évêque auxiliaire du diocèse de Bâle, troisième membre de la présidence.